Я знаю,что есть утилита NTFSDOS она умеет писать на разделы NTFS из Dos'a испоьзую при этом драйвер ntfs.sys и
ntoskrnl.exe.Методом логики я понял, что копирование усушествляется за счет ntfs.sys и возможно библиотеки ntoskrnl.exe. Вопрос:какие для этого функции надо вызывать, вообшем КАК осуществляется видимость NTFS-дисков и копирование на них.

Ты поднял очень сложную тему. Боюсь, ответов будет немного.
Я бы советовал посмотреть на
http://sourceforge.net/projects/linux-ntfs/